A toxina botulínica também pode ser adotada para tratar a hiperidrose axilar. Essa condição provoca suor excessivo, mesmo durante repouso ou diante de temperaturas mais amenas. A substância bloqueia a transmissão nervosa das glândulas sudoríparas na região em que é utilizada, eliminando o suor excessivo. Quando aplicada nas axilas, a toxina ajuda a manter a sudorese sob controle por cerca de nove meses.